小・中学生がフリースクールに通学する際、交通機関の学割が使えるかどうか？

　可能です。不登校の生徒が、指導・相談を行う学校外の公的機関や民間施設に通所するため鉄道又は乗合バスに乗車する場合、通学定期乗車券が関係の交通事業者の理解と協力の下に適用されます。

　対象となる生徒は学校外の公的機関や民間施設において相談・指導を受けている不登校生徒で、当該生徒の在籍校の校長先生が、当該相談・指導を受けた日数を指導要録上の出席扱いとすることができることとした者。

　手続は、校長先生が通学定期券の購入に必要な申請書の提出などの必要な手続きを行い、適切かつ円滑な運用に努めること。

　となっています。具体的には、各フリースクール・フリースペースに相談して、学校にお願いしてみてください。